Clostridium difficile é um bacilo gram positivo formador de esporos que foi associado a doenças pela primeira vez em 1978. Atualmente, é um dos mais importantes patógenos causadores de diarréia em ambito hospitalar ou em casas de repouso, causando elevada mortalidade e morbidade. A microbiota colica adulta é normalmente resistente à colonização por C. difficile. No entanto, se esta microbiota é alterada, como por exemplo o uso de antibioticoterapia, essa resistência desaparece ficando susceptivel à infecção, por esta razão é considerado um dos principais causadores de colite pseudomembranosa associado ao uso de antimicrobiano.